安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“qvalue”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qvalue。
Bioconductor版本:3.2
这个包需要假定值的列表结果同步测试的许多假设和估计其q值和地方罗斯福值。测试测量的核反应能量的比例发生假阳性(称为错误发现率)在特定的测试称为意义重大。当地的罗斯福措施后验概率的零假设是正确测试的假定值。各种阴谋是自动生成的,允许一个合理意义的否决。几个数学结果最近被证明保守估计的准确性q值从这个软件。该软件可以应用于基因组学中存在的问题,脑成像、天体物理学和数据挖掘。
作者:约翰·d·安德鲁·j·巴斯层与来自艾伦Dabney和大卫罗宾逊
维修工:约翰·d·层< jstorey princeton.edu >,安德鲁j .低音< ajbass princeton.edu >
从内部引用(R,回车引用(“qvalue”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“qvalue”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“qvalue”)
qvalue包 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | MultipleComparisons,软件 |
版本 | 2.2.2 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | LGPL |
取决于 | R (> = 2.10) |
进口 | 样条函数,ggplot2、网格reshape2 |
链接 | |
建议 | knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://github.com/jdstorey/qvalue |
取决于我 | anota,CancerMutationAnalysis,ChimpHumanBrainData,DEGseq,DrugVsDisease,metaseqR,prot2D,r3Cseq,SSPA,webbioc |
进口我 | anota,clusterProfiler,derfinder,剂量,边缘,erccdashboard,msmsTests,netresponse,Rnits,sRAP,subSeq,synapter,触发,webbioc |
建议我 | biobroom,LBE,maanova,PREDA,RNAinteractMAPK |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | qvalue_2.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | qvalue_2.2.2.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | qvalue_2.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | qvalue_2.2.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/qvalue/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qvalue/ |
包下载报告 | 下载数据 |