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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pwOmics。

Pathway-based组学数据的数据集成

Bioconductor版本:3.2

pwOmics执行pathway-based level-specific数据比较匹配的组学数据集基于pre-analysed指定列表的微分基因/转录和蛋白质。一个单独的下游蛋白质组学数据的分析包括路径识别和富集分析,转录因子识别和目标基因识别反对上游分析从基因或转录信息作为依据确定上游转录因子和监管机构。跨平台的比较分析允许单个时间点实验的综合分析和时间序列的实验为数据集成提供了静态和动态分析工具。

作者:阿斯特丽德韦希特尔<阿斯特丽德。韦希特尔在med.uni-goettingen.de >

维护人员:阿斯特丽德韦希特尔<阿斯特丽德。韦希特尔在med.uni-goettingen.de >

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PDF		pwOmics
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneTarget,软件,SystemsBiology,转录
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(1年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.2)
进口	data.table,rBiopaxParser,igraph,STRINGdb、图形、gplots,Biobase,BiocGenerics,AnnotationDbi,biomaRt,AnnotationHub,GenomicRanges
链接
建议	ebdbNet,纵向,Mfuzz
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	pwOmics_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	pwOmics_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	pwOmics_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	pwOmics_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/pwomics/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pwOmics/
包下载报告	下载数据