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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅neaGUI。

R包执行网络富集分析(NEA)。

Bioconductor版本:3.2

neaGUI是一个易于使用R包开发执行网络富集分析(NEA)提出的Alexeyenko et al。(2012)。NEA方法扩展了重叠统计GSEA网络基因之间的联系,在实验设置和功能类别利用生物信息的基因相互作用网络。neaGUI需要以下R包:tcltk KEGG。db,走了。db, reactome。db, org.Hs.eg。db, AnnotationDbi hwriter。

作者:Setia Pramana, Woojoo Lee Yudi Pawitan

维护人员:Setia Pramana < Setia。在ki.se pramana >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“neaGUI”)

PDF		neaGUI装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,去,GUI,GeneSetEnrichment,KEGG,微阵列,网络,NetworkEnrichment,通路,Reactome,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	tcltk
进口	hwriter
链接
建议	AnnotationDbi,org.Hs.eg.db,KEGG.db,GO.db,reactome.db,RUnit,GOstats,hwriter
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	EnrichmentBrowser
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	neaGUI_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	neaGUI_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	neaGUI_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	neaGUI_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/neagui/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/neaGUI/
包下载报告	下载数据