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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅minfi。

分析Illumina公司的450 k甲基化数组

Bioconductor版本:3.2

分析和可视化工具Illumina公司的450 k数组数据。

作者:Kasper丹尼尔·汉森(cre, aut),马丁·阿尔耶前来(aut),拉斐尔·a·伊(aut),安德鲁·e·贾菲(施)Jovana Maksimovic(施),e·安德烈斯豪斯曼(施),让-菲利普•福丁(施),蒂姆Triche[所有],山安德鲁斯(施)

维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >

安装

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PDF		Minfi指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation,DataImport,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.16.1
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.15.3),Biobase(> = 2.17.8),晶格,GenomicRanges,SummarizedExperiment(> = 0.3.1),Biostrings跑龙套,bumphunter(> = 1.1.9)
进口	S4Vectors,GenomeInfoDb,IRanges,beanplot,RColorBrewer,nor1mix,siggenes,limma,preprocessCore,illuminaio,matrixStats,mclust,genefilter,nlme,重塑,质量,quadprog,GEOquery,mixOmics
链接
建议	IlluminaHumanMethylation450kmanifest(> = 0.2.0),IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19(> = 0.2.1),minfiData(> = 0.4.1),FlowSorted.Blood.450k(> = 1.0.1),RUnit,消化,data.table
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kasperdanielhansen/minfi
BugReports	https://github.com/kasperdanielhansen/minfi/issues
取决于我	冠军,conumee,CopyNumber450k,CopyNumber450kData,DMRcate,ENmix,FlowSorted.Blood.450k,FlowSorted.DLPFC.450k,IlluminaHumanMethylation27kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19,IlluminaHumanMethylationEPICmanifest,methylumi,minfiData,shinyMethyl
进口我	埃尔默,餐,MethylAid,methylumi,missMethyl,quantro,skewr
建议我	RnBeads
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	minfi_1.16.1.tar.gz
Windows二进制	minfi_1.16.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	minfi_1.16.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	minfi_1.16.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/minfi/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/minfi/
包下载报告	下载数据