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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见methylPipe．

碱基分辨率DNA甲基化数据分析

Bioconductor版本:3.2

在CpG和非CpG序列背景下，记忆高效的碱基分辨率DNA甲基化数据分析。整合来自任何提供基本或低分辨率数据的方法的DNA甲基化数据。

作者:Kamal Kishore

维护者:Kamal Kishore < Kamal。Fartiyal84在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“methylPipe”)

文档

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browseVignettes(“methylPipe”)

PDF		methylPipe.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，DNAMethylation，MethylSeq，测序，软件
版本	1.4.5
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 3.2.0)，方法，grDevices，图形，统计，utils，GenomicRanges，SummarizedExperiment(> = 0.2.0),Rsamtools
进口	marray，gplots，IRanges，BiocGenerics，Gviz，GenomicAlignments，Biostrings平行,data.table，GenomeInfoDb，S4Vectors
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene，knitr，MethylSeekR
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	ListerEtAlBSseq
进口我	compEpiTools
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	methylPipe_1.4.5.tar.gz
Windows二进制	methylPipe_1.4.5.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	methylPipe_1.4.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	methylPipe_1.4.5.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/methylPipe/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/methylPipe/
软件包下载报告	下载数据