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这个包是弃用．它可能会被从生物导体中移除。请参阅包临终的指导方针为更多的信息。

此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见metaX．

代谢组学数据分析的R包

Bioconductor版本:3.2

该包为基于质谱的代谢组学数据分析提供了一个集成的管道。包括阶段峰值检测、数据预处理、归一化、缺失值归一化、单变量统计分析、PCA和PLS-DA等多变量统计分析、代谢物鉴定、路径分析、功率分析、特征选择与建模、数据质量评估等。

作者:博文<文博在genome .cn>

维持者:博文<文博在genome .cn>

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“metaX”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“metaX”)

PDF		metaX教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MassSpectrometry，代谢组学，质量控制，软件
版本	1.0.3
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年)
许可证	LGPL-2
取决于	R (> = 3.2.0),维恩图，pROC，SSPA、方法
进口	喷嘴。R1，ggplot2平行,pcaMethods，reshape2，plyr，BBmisc，mixOmics，preprocessCore，vsn，请，嫁祸于，missForest，doParallel，DiscriMiner，xcms，猿，scatterplot3d，pheatmap，引导，引导，脱字符号，dplyr，stringr，RColorBrewer，DiffCorr，RCurl，晶格，faahKO，data.table，相机，igraph
链接
建议	knitr，BiocStyle，R.utils，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	metaX_1.0.3.tar.gz
Windows二进制	metaX_1.0.3.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	metaX_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	metaX_1.0.3.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/metaX/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/metaX/
包下载报告	下载数据