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林玛

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅林玛

微阵列数据的线性模型

生物导体版本:3.2

数据分析,线性模型和微阵列数据的差异表达。

作者:Gordon Smyth [Cre,Aut],Matthew Ritchie [CTB],Jeremy Silver [CTB],James Wettenhall [CTB],Natalie Thorne [CTB],Davis McCarthy [CTB],Di Wu [CTB],Yifang Hu [CTB [CTB]],Wei Shi [CTB],Belinda Phipson [CTB],Alicia Oshlack [CTB],Carolyn de Graaf [CTB],Mette Langaas [CTB],Egil Ferkingstad [CTB],Marcus Davy [CTB],Francois Pepin [CTB] [CTB] [CTB] [CTB] [CTB] [CTB] [CTB] [CTB],Dongseok Choi [CTB],Aaron Lun [CTB]

维护者:gordon smyth

引用(从r内,输入引用(“ Limma”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ Limma”)

PDF Limma一页简介
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PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,批处理效应,,,,贝叶斯,,,,聚类,,,,DataImport,,,,差异性,,,,差速器,,,,exonarray,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,遗传学,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,正常化,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,专有Platratforms,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,回归,,,,软件,,,,时间科,,,,转录,,,,两通道,,,,Mrnamicroarray,,,,MicroRNAARRAY
版本 3.26.9
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 11年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.3.0)
进口 grdevices,图形,统计,utils,方法
链接
建议 副词,,,,AnnotationDbi,,,,偏见,,,,生物酶,,,,椭圆,,,,go.db,,,,Illuminaio,,,,Locfit,,,,大量的,,,,org.hs.eg.db,花键,Statmod(> = 1.2.2),VSN
系统要求
增强
URL http://bioinf.wehi.edu.au/limma
取决于我 A4base,,,,AffyExpress,,,,agimicrorna,,,,吸引,,,,比尔塔,,,,卡利布,,,,CCL4,,,,CGHMCR,,,,嵌合体脑,,,,克利普达,,,,codelink,,,,兑换,,,,Cormotif,,,,康奈,,,,差异,,,,drugvsdisease,,,,EDGER,,,,eximir,,,,女性,,,,Fletcher2013a,,,,GCMAP,,,,HD2013SGI,,,,htqpcr,,,,迈格巴克,,,,mapredictdsc,,,,Marray,,,,元基因组,,,,metaseqr,,,,mlseq,,,,mmpalatemirna,,,,PROT2D,,,,qpcrnorm,,,,Qusage,,,,RBM,,,,林戈,,,,rnbeads,,,,rnits,,,,Snapcgh,,,,SSPA,,,,翻译,,,,涡轮瘤,,,,西瓜
进口我 absseq,,,,Affycoretools,,,,affylmgui,,,,ArrayExpress,,,,阵列,,,,ArrayQualityMetrics,,,,Arraytools,,,,吸引,,,,舞会礼服,,,,Beadarray,,,,Beadarrayusecases,,,,betr,,,,Birte,,,,气泡,,,,Bumphunter,,,,卡利布,,,,取消分析,,,,卡斯珀,,,,冠军,,,,魅力,,,,芯片,,,,Chippeakanno,,,,compcoder,,,,CSAW,,,,达帕尔,,,,derfinderplot,,,,Diffhic,,,,dmelsgi,,,,dmrcate,,,,富集兄弟,,,,Erccdashboard,,,,探索酶,,,,Flowbin,,,,geneselectmmd,,,,基因主管,,,,GGBASE,,,,Gosummaries,,,,gqtlstats,,,,htqpcr,,,,Icheck,,,,Ichip,,,,inpas,,,,利马瓜,,,,lmdme,,,,lvsmirna,,,,MAPKL,,,,Masigpro,,,,一顿饭,,,,Minfi,,,,Mirlab,,,,甲基小姐,,,,mmpalatemirna,,,,单片,,,,MSSTATS,,,,NEM,,,,nethet,,,,无索引,,,,OGSA,,,,奥林,,,,PAA,,,,padog,,,,佩卡,,,,pepstat,,,,,,,,聚酯纤维,,,,RCGH,,,,报告工具,,,,林戈,,,,rnainteract,,,,rnaither,,,,rtcgatoolbox,,,,RTN,,,,rtopper,,,,simbindprofiles,,,,Snapcgh,,,,stategra,,,,Systempiper,,,,tcgabiolinks,,,,时间科,,,,topaseq,,,,Tweedeseq,,,,方差分区,,,,VSN
建议我 Abarray,,,,adacgh2,,,,Beadarraysnp,,,,生物室,,,,生物探测,,,,Bionet,,,,类别,,,,类别Compare,,,,分类,,,,CMA,,,,齿轮,,,,染料,,,,弯头,,,,量规,,,,基因主管,,,,地球,,,,GSRI,,,,GSVA,,,,热倍,,,,inimilicodb,,,,isobar,,,,莱斯,,,,Lumi,,,,哺乳动物,,,,MDGSA,,,,甲基菌,,,,MLP,,,,NPGSEA,,,,奥利戈,,,,Onechannelgui,,,,Paxtoolsr,,,,PGSEA,,,,钢琴,,,,plw,,,,preda,,,,彪马,,,,rcade,,,,rtopper,,,,rtracklayer,,,,七十年代,,,,subseq,,,,SVA
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 limma_3.26.9.tar.gz
Windows二进制 limma_3.26.9.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) limma_3.26.1.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) limma_3.26.9.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/limma/tree/release-3.2
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/limma/
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