# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“hiReadsProcessor”)

这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅hiReadsProcessor。

函数来处理LM-PCR从454 / Illumina公司数据读取

Bioconductor版本:3.2

hiReadsProcessor包含的函数允许用户进程LM-PCR产品排序使用任何平台。给定一个excel /多路分解txt文件包含参数和样本的元数据,自动调整功能基因组的适配器和识别产品。基因产品进一步加工的质量控制和丰富量化。

作者:Nirav V Malani < malnirav gmail.com >

维护人员:Nirav V Malani < malnirav gmail.com >

安装

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细节

biocViews	预处理,测序,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	Biostrings,GenomicAlignments,xlsx,BiocParallel,hiAnnotatorR (> = 3.0)
进口	sonicLength,dplyr,GenomicRanges,BiocGenerics,rSFFreader
链接
建议	knitr,testthat
SystemRequirements	咩咩咩咩的叫声,UCSC hg18 2位格式
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	hiReadsProcessor_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	hiReadsProcessor_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	hiReadsProcessor_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	hiReadsProcessor_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/hireadsprocessor/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hiReadsProcessor/
包下载报告	下载数据