安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“gtrellis”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gtrellis。
Bioconductor版本:3.2
基因组水平格子图可视化基因数据受制于基因类别(如染色体)。对于每个基因组的类别,多个维度数据被表示为跟踪描述从不同的方面不同的特性。这个包提供高灵活性安排基因类别和添加自定义图形的阴谋。
作者:Zuguang顾
维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >
从内部引用(R,回车引用(“gtrellis”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“gtrellis”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“gtrellis”)
HTML | 使基因组水平格子图 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 测序,软件,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(1年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(> = 3.1.2),网格 |
进口 | circlize(> = 0.2.3),GetoptLong |
链接 | |
建议 | testthat(> = 0.3),knitr,GenomicRanges,RColorBrewer,减价 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/jokergoo/gtrellis |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | gtrellis_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | gtrellis_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | gtrellis_1.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | gtrellis_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/gtrellis/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gtrellis/ |
包下载报告 | 下载数据 |