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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见genomation．

基因组数据汇总、注释和可视化

Bioconductor版本:3.2

基因组间隔的总结和注释包。用户可以可视化和量化预定义功能区域的基因组间隔，如启动子、外显子、内含子等。基因组间隔表示具有确定的染色体位置的区域，这可能与分数相关，例如HT-seq实验的对齐读数、TF结合位点、甲基化分数等。该软件包可以使用任何表格基因组特征数据，只要它有最少的基因组间隔的位置信息。此外，它可以使用BAM或BigWig文件作为输入。

作者:Altuna Akalin [aut, cre]， Vedran Franke [aut, cre]， Katarzyna wreck zycka [aut]， Liz Ing-Simmons [ctb]

维护者:Altuna Akalin ， Vedran Franke

安装

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文档

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超文本标记语言		genomation
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，CpGIsland，测序，软件，可视化
版本	1.2.2
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.0.0)，网格
进口	Biostrings，BSgenome，data.table，GenomeInfoDb，GenomicRanges，GenomicAlignments，ggplot2，gridBase，嫁祸于，IRanges，matrixStats，方法，并行，plotrix，plyr，readr，reshape2，Rsamtools，seqPattern，rtracklayer
链接
建议	BiocGenerics，genomationData，knitr，knitrBootstrap，RColorBrewer，rmarkdown，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	http://bioinformatics.mdc-berlin.de/genomation/
BugReports	https://github.com/BIMSBbioinfo/genomation/issues
全靠我
进口我	CexoR
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	genomation_1.2.2.tar.gz
Windows二进制	genomation_1.2.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	genomation_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	genomation_1.2.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/genomation/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genomation/
软件包下载报告	下载数据