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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅geecc。

基因集富集分析扩展到应急数据集

Bioconductor版本:3.2

使用对数线性模型来执行超几何和卡方测试基因设置充实两个(基于列联表)或三个类别(应急数据集)。类别可以差异表达基因,条款,序列长度,GC含量,chromosmal位置,phylostrata, ....

作者:马库斯Boenn

维护人员:马库斯Boenn <马库斯。在ufz.de boenn >

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PDF		geecc用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	BiologicalQuestion,去,GeneExpression,GeneSetEnrichment,微阵列,RNASeq,软件,StatisticalMethod,转录,WorkflowStep
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(1.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.0.0)方法
进口	质量,hypergea(> = 1.2.3),gplots
链接
建议	hgu133plus2.db,GO.db,AnnotationDbi
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	geecc_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	geecc_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	geecc_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	geecc_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/geecc/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geecc/
包下载报告	下载数据