要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“flipflop”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

啪嗒啪嗒地响

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见啪嗒啪嗒地响

基于套索的异构体快速预测作为流动问题

Bioconductor版本:3.2

Flipflop根据RNA-Seq读取数据,发现在给定样本中表达的基因亚型及其丰度。它接受SAM格式的对齐文件作为输入。它还可以同时发现来自多个样本的转录本,增加统计能力。

作者:Elsa Bernard, Laurent Jacob, Julien Mairal, Jean-Philippe Vert

维护者:Elsa Bernard < Elsa。Bernard在mines-paristech.fr>

引文(从R内,输入引用(“触发器”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“flipflop”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“触发器”)

PDF FlipFlop:基于套索的快速异型预测流问题
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicingRNASeqRNASeqData回归软件
版本 1.8.2
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.10.0)
进口 方法,矩阵IRangesGenomicRanges、并行
链接
建议 GenomicFeatures
SystemRequirements GNU使
增强了
URL http://cbio.ensmp.fr/flipflop
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 flipflop_1.8.2.tar.gz
Windows二进制 flipflop_1.8.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) flipflop_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) flipflop_1.8.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/flipflop/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/flipflop/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心