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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅epivizr。

R接口epiviz web应用程序

Bioconductor版本:3.2

这个包提供了Websocket沟通epiviz web应用程序(http://epiviz.cbcb.umd.edu)的基因组数据的交互式可视化。R / bioc交互式会话中的对象可以显示在基因组浏览器追踪或情节被导航探索基因组区域。支持基本Bioconductor数据结构(例如,GenomicRanges和RangedSummarizedExperiment对象),同时提供一个简单的机制来支持其他数据结构。可视化(使用d3.js)可以很容易地添加到web应用程序。

作者:赫克托耳Corrada布拉沃,弗罗林Chelaru,卢埃林史密斯,娜奥米·戈尔茨坦

维修工:赫克托耳Corrada布拉沃< hcorrada gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“epivizr”)

文档

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细节

biocViews	GUI,基础设施,软件,可视化
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.0.1)、方法Biobase,SummarizedExperiment(> = 0.2.0),rtracklayer
进口	S4Vectors,httpuv(1.3.0 > =版本),rjson,OrganismDbi,R6(> = 2.0.0),mime(> = 0.2),GenomeInfoDb,GenomicRanges,GenomicFeatures
链接
建议	testthat,roxygen2,knitr,antiProfilesData,hgu133plus2.db,knitrBootstrap,Mus.musculus
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	epivizr_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	epivizr_1.8.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	epivizr_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	epivizr_1.8.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/epivizr/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epivizr/
包下载报告	下载数据