要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ cummerbund”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

腹带

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅腹带

袖扣高通量测序数据的分析,探索,操纵和可视化。

生物导体版本:3.2

允许持续存储,访问,探索和操纵袖扣高通量测序数据。此外,为常用可视化提供了许多绘图功能。

作者:L。Goff,C。Trapnell,D。Kelley

维护者:忠诚的A. Goff

引用(从r内,输入引用(“康姆斯邦”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cummerbund”)

PDF Cummerbund用户指南
PDF 样本Cummerbund工作流程
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 生物信息学,,,,聚类,,,,DataImport,,,,datarepresentation,,,,差异性,,,,基因表达,,,,高通量序列,,,,高通量序列数据,,,,基础设施,,,,多蛋白酶,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,rnaseqdata,,,,软件,,,,可视化
版本 2.12.1
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.7.0),生物基因(> = 0.3.2),rsqlite,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2,,,,快速积分,,,,rtracklayer,,,,GVIZ
进口 方法,plyr,,,,生物基因,,,,生物酶
链接
建议 ,,,,plyr,,,,NMFN,,,,Stringr,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,rjson
系统要求
增强
URL
取决于我 MESHR,,,,拼接器
进口我
建议我 Onechannelgui
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 cummerbund_2.12.1.tar.gz
Windows二进制 cummerbund_2.12.1.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) cummerbund_2.12.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) cummerbund_2.12.1.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/cummerbund/tree/release-3.2
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cummerbund/
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