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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅compEpiTools。

工具计算表观基因组学

Bioconductor版本:3.2

分析计算表观基因组学工具开发,集成和同步可视化的各种跨多个基因组(epi)基因组学数据类型地区多个样本。

作者:http://genomics.iit.it/groups/computational-epigenomics.html

维护人员:Kamal基肖尔<卡马尔。在gmail.com fartiyal84 >

安装

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文档

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PDF		compEpiTools.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道,GeneExpression,GenomeAnnotation,测序,软件,可视化
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(1.5年)
许可证	GPL
取决于	R(> = 3.1.1)、方法topGO,GenomicRanges
进口	AnnotationDbi,BiocGenerics,Biostrings,Rsamtools、平行、grDevicesgplots,IRanges,GenomicFeatures,XVector,methylPipe,GO.db,S4Vectors,GenomeInfoDb
链接
建议	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,org.Mm.eg.db,knitr,rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	compEpiTools_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	compEpiTools_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	compEpiTools_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	compEpiTools_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/compepitools/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/compEpiTools/
包下载报告	下载数据