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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见chipenrich．

ChIP-seq峰值数据的基因集富集

Bioconductor版本:3.2

ChIP-Enrich使用来自ChIP-seq实验的峰进行基因集富集测试。该方法对基因长度、基因周围序列的可映射性等混杂因素进行了经验校正。

作者:Ryan P. Welch [aut, cre, cph]， Chee Lee [aut, cre]， Raymond G. Cavalcante [aut, cre]， Laura J. Scott [ths]， Maureen A. Sartor [ths]

维护者:Raymond G. Cavalcante ， Chee Lee

安装

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文档

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browseVignettes(“chipenrich”)

PDF		ChIP-Enrich装饰图案/教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学，浓缩，GeneSetEnrichment，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.15.1)
进口	chipenrich.data、方法、GenomicRanges(> = 1.10.0),IRanges(> = 1.16.0),mgcv，plyr(> = 1.7.0),晶格，latticeExtra、网格stringr(> = 0.6),rms
链接
建议	testthat
SystemRequirements
增强了	平行
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	chipenrich_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	chipenrich_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	chipenrich_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	chipenrich_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/chipenrich/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipenrich/
软件包下载报告	下载数据