要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“chimera”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

嵌合体

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见嵌合体

熔合产品的二次分析包

Bioconductor版本:3.2

这个包有助于融合产品事件的描述。支持从chimeraScan、bellerophontes、化解、FusionFinder、FusionHunter、mapSplice、tophat-fusion、FusionMap、STAR、Rsubread、fusionCatcher导入融合数据结果。

作者:Raffaele A Calogero, Matteo Carrara, Marco Beccuti, Francesca Cordero

维护者:Raffaele A Calogero < Raffaele。卡洛杰罗在unito, >

引文(从R内,输入引用(“嵌合体”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“chimera”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“嵌合体”)

PDF 嵌合体
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 BiobaseGenomicRanges(> = 1.13.3),Rsamtools(> = 1.13.1),GenomicAlignments、方法、AnnotationDbiBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneHomo.sapiens
进口
链接
建议 BiocParallelgeneplotter
SystemRequirements STAR, TopHat,蝴蝶结和samtools的一些功能是必需的
增强了 RsubreadBSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGeneBSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGeneMus.musculusBSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
URL
全靠我 oneChannelGUI
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 chimera_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 chimera_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) chimera_1.12.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) chimera_1.12.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/chimera/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/chimera/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心