要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cellHTS2”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

cellHTS2

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见cellHTS2

细胞筛选的分析。cellHTS的修订版

Bioconductor版本:3.2

该软件包提供了分析以微量滴定板格式(包括但不限于384孔板)进行的高通量分析的工具。功能包括数据导入和管理、规范化、质量评估、复制摘要和统计评分。生成一个网页,提供数据和分析结果的详细图形概述。在我们的工作中,我们已经将该包应用于苍蝇和人类细胞的RNAi筛选,以及酵母文库的筛选。参见?cellHTS2获得简要介绍。

作者:Ligia Bras, Wolfgang Huber , Michael Boutros , Gregoire Pau , Florian Hahne < Florian。Hahne在novarti.com >

维护者:Joseph Barry < Joseph。Barry在embl.de>

引文(从R内,输入引用(“cellHTS2”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cellHTS2”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“cellHTS2”)

PDF 主要插图(完整版本):基于单元格的屏幕的端到端分析
PDF 主要插图:基于单元的屏幕的端到端分析
PDF 补充:增强-抑制筛选
PDF 补充:多通道测定
PDF 参考手册

细节

biocViews CellBasedAssays预处理软件可视化
版本 2.34.1
在Bioconductor BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),RColorBrewerBiobase、方法、genefiltersplotsvsnhwriterlocfit、网格
进口 普拉达GSEABase类别, stats4
链接
建议 ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL http://www.dkfz.de/signalinghttp://www.ebi.ac.uk/huber
全靠我 coRNAiimageHTSstaRank
进口我 gespeRHTSanalyzeRRNAinteract
建议我 bioassayR
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 cellHTS2_2.34.1.tar.gz
Windows二进制 cellHTS2_2.34.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) cellHTS2_2.34.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) cellHTS2_2.34.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/cellHTS2/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cellHTS2/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心