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卡斯珀
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此软件包适用于生物导体的3.2版；对于稳定的最新版本，请参阅卡斯珀。
基于配对末端读取的替代剪接的表征
生物导体版本：3.2
从配对端RNA-seq数据中推断出替代剪接。该模型基于跨外显子的计数路径，而不是成对的外显子连接，并非参数估算片段大小和启动分布，从而提高了估计精度。
作者：David Rossell，Camille Stephan-Totto，Manuel Kroiss，Miranda Stobbe，Victor Pena
维护者：David Rossell
引用（从r内，输入引用（“卡斯珀”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Casper”）
| DesignRnaseq.pdf | ||
| 卡斯珀图书馆的手册 | ||
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，转录 |
| 版本 | 2.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（3年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 2.14.1），生物酶，，，，iranges， 方法，基因组机 |
| 进口 | 生物基因，，，，结尾，，，，ebarrays，，，，加加，，，，gtools，，，，GenomeInfodB，，，，GenomicFeatures，，，，林玛，，，，MGCV，，，，rsamtools，，，，rtracklayer，，，，S4VECTORS，，，，SQLDF，，，，生存，，，，VGAM |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | 平行 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | casper_2.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | casper_2.4.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | casper_2.4.0.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | casper_2.4.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/casper/tree/release-3.2 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/casper/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
