要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“bumphunter”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

bumphunter

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见bumphunter

撞猎人

Bioconductor版本:3.2

在基因组数据中发现凸起的工具

作者:Rafael A. Irizarry [cre, aut], Martin Aryee [aut], Kasper Daniel Hansen [aut], Hector Corrada Bravo [aut], Shan Andrews [ctb], Andrew E. Jaffe [ctb], Harris Jaffee [ctb], Leonardo Collado-Torres [ctb]

维护者:Rafael A. Irizarry

引文(从R内,输入引用(“bumphunter”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“bumphunter”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“bumphunter”)

PDF bumphunter用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation表观遗传学基础设施MultipleComparison软件
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),S4Vectors(> = 0.7.20),IRanges(> = 2.3.23),GenomeInfoDbGenomicRangesforeach迭代器,方法,并行,locfit
进口 matrixStatslimmadoRNGBiocGenerics跑龙套,GenomicFeaturesAnnotationDbi
链接
建议 testthatRUnitdoParallelorg.Hs.eg.dbTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/ririzarr/bumphunter
全靠我 minfi
进口我 derfinderregionReport
建议我 derfinderPlot
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 bumphunter_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 bumphunter_1.10.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) bumphunter_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) bumphunter_1.10.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/bumphunter/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bumphunter/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心