要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“bsseq”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见bsseq.
Bioconductor版本:3.2
一组分析和可视化亚硫酸氢盐测序数据的工具。
作者:Kasper Daniel Hansen [aut, cre], Peter Hickey [ctb]
维护者:Kasper Daniel Hansen
引文(从R内,输入引用(“bsseq”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“bsseq”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“bsseq”)
用bsseq分析WGBS | ||
bsseq用户指南 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNAMethylation,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.15),方法,BiocGenerics,IRanges(> = 2.1.10),GenomicRanges(> = 1.19.6),SummarizedExperiment(>= 0.1.1),平行,GenomeInfoDb |
进口 | 尺度,统计,图形,Biobase,locfit,gtools,data.table,S4Vectors,R.utils(> = 2.0.0),matrixStats |
链接 | |
建议 | RUnit,bsseqData,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq |
BugReports | https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq/issues |
全靠我 | bsseqData,DSS |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | bsseq_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | bsseq_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | bsseq_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | bsseq_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/bsseq/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bsseq/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |