要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“bsseq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

bsseq

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见bsseq

分析、管理和存储亚硫酸氢盐测序数据

Bioconductor版本:3.2

一组分析和可视化亚硫酸氢盐测序数据的工具。

作者:Kasper Daniel Hansen [aut, cre], Peter Hickey [ctb]

维护者:Kasper Daniel Hansen

引文(从R内,输入引用(“bsseq”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“bsseq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“bsseq”)

PDF 用bsseq分析WGBS
PDF bsseq用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation软件
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.15),方法,BiocGenericsIRanges(> = 2.1.10),GenomicRanges(> = 1.19.6),SummarizedExperiment(>= 0.1.1),平行,GenomeInfoDb
进口 尺度,统计,图形,Biobaselocfitgtoolsdata.tableS4VectorsR.utils(> = 2.0.0),matrixStats
链接
建议 RUnitbsseqDataBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq
BugReports https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq/issues
全靠我 bsseqDataDSS
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 bsseq_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 bsseq_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) bsseq_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) bsseq_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/bsseq/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bsseq/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心