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此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅Birte。
生物导体版本:3.2
mRNA分子的表达水平由不同的过程调节,包括转录因子的抑制或激活,并通过microRNAS进行转录后降解。Birte使用TFS,miRNA和可能其他因素的调节网络以及mRNA,miRNA和其他可用表达数据来预测调节剂对其靶基因表达的相对影响。推理是在使用Markov-Chain-Monte-Carlo的贝叶斯建模框架中进行的。一个特殊功能是在主动调节器之间进行后续网络反向工程的可能性。
作者:Holger Froehlich,Benedikt Zacher的贡献
维护者:holger froehlich
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贝叶斯对转录活性调节的推断 | ||
参考手册 | ||
文本 | 读书我 |
生物浏览 | 贝叶斯,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,网络,,,,网络引导,,,,回归,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.6.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(1年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.0.0),rcpparmadillo(> = 0.3.6.1),RCPP |
进口 | 大量的,,,,林玛(> = 3.22.0),Glmnet,,,,生物酶,,,,NEM |
链接 | rcpparmadillo,,,,RCPP |
建议 | 尼特 |
系统要求 | Blas,拉帕克 |
增强 | rgraphviz |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Birte_1.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | birte_1.6.1.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | Birte_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | Birte_1.6.1.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/birte/tree/release-3.2 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/birte/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |