要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“baySeq”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见baySeq.
Bioconductor版本:3.2
该软件包识别高通量“计数”数据中的差异表达,例如来自下一代测序机的数据,通过经验贝叶斯方法计算差异表达(或更复杂的假设)的估计后验可能性。
作者:Thomas J. Hardcastle
维护者:Thomas J. Hardcastle
引文(从R内,输入引用(“baySeq”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“baySeq”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“baySeq”)
高级baySeq分析 | ||
baySeq | ||
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,MultipleComparison,圣人,测序,软件 |
版本 | 2.4.1 |
在Bioconductor | BioC 2.5 (R-2.10)(6.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(>= 2.3.0),方法,GenomicRanges,abind,烫 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 刨边机,BiocStyle,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | 埃达,Rcade,segmentSeq,移行细胞癌 |
进口我 | 埃达,metaseqR |
建议我 | compcodeR,oneChannelGUI,riboSeqR |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | baySeq_2.4.1.tar.gz |
Windows二进制 | baySeq_2.4.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | baySeq_2.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | baySeq_2.4.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/baySeq/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/baySeq/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |