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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见affyPLM．

探针级模型的拟合方法

Bioconductor版本:3.2

扩展和改进基本affy包功能的包。为了提高速度而大量使用已编译代码的例程。重点是实现用于拟合探针级模型的方法和使用这些模型的工具。基于PLM的质量评估工具。

作者:Ben Bolstad

维护者:Ben Bolstad

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affyPLM”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“affyPLM”)

PDF		affyPLM: mapplot函数的高级使用
PDF		affyPLM:拟合探针水平模型
PDF		affyPLM: Affymetrix基因芯片基于模型的质量控制评估
PDF		affyPLM:三步函数
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，预处理，质量控制，软件
版本	1.46.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.6.0)，BiocGenerics(> = 0.3.2),affy(> = 1.11.0),Biobase(> = 2.17.8),gcrma统计数据,preprocessCore(> = 1.5.1)
进口	BiocGenerics，zlibbioc，图形，grDevices，方法
链接	preprocessCore
建议	affydata，质量
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/bmbolstad/affyPLM
全靠我	RefPlus
进口我	affylmGUI，affyQCReport，arrayQualityMetrics
建议我	AffyExpress，arrayMvout，ArrayTools，BiocCaseStudies，BiocGenerics，肘，frmaTools，metahdep，oneChannelGUI，钢琴
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	affyPLM_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	affyPLM_1.46.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	affyPLM_1.46.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	affyPLM_1.46.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/affyPLM/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affyPLM/
软件包下载报告	下载数据