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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅VariantTools。

工具使用的遗传变异

Bioconductor版本:3.2

检测工具、过滤、调用、比较和策划变体。

作者:迈克尔·劳伦斯,耶利米Degenhardt,罗伯特先生

维护人员:迈克尔·劳伦斯< michafla gene.com >

安装

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文档

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PDF		介绍VariantTools
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,测序,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	S4Vectors(> =发布),IRanges(> = 1.99.2),GenomicRanges(> = 1.17.7),VariantAnnotation(> = 1.11.16)方法
进口	Rsamtools(> = 1.17.6),BiocGenerics,Biostrings平行,gmapR(> = 1.7.2),GenomicFeatures(> = 1.17.13),矩阵,rtracklayer(> = 1.25.3),BiocParallel,GenomeInfoDb,BSgenome,Biobase
链接
建议	RUnit,LungCancerLines(> = 0.0.6),RBGL,图
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	HTSeqGenie
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	VariantTools_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/varianttools/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/VariantTools/
包下载报告	下载数据