要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“VanillaICE”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

VanillaICE

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见VanillaICE

高通量基因分型阵列的隐马尔可夫模型

Bioconductor版本:3.2

用于表征高通量SNP阵列中染色体改变的隐马尔科夫模型。

作者:Robert Scharpf , Kevin Scharpf, and Ingo Ruczinski < Ingo at jhsph.edu>

维护者:Robert Scharpf

引文(从R内,输入引用(“VanillaICE”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“VanillaICE”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“VanillaICE”)

PDF crlmmDownstream
PDF VanillaICE装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariation软件
版本 1.32.2
在Bioconductor BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证 LGPL-2
取决于 R (>= 3.0.0),BiocGenerics(> = 0.13.6),GenomicRanges(> = 1.19.47),SummarizedExperiment(> = 0.2.0)
进口 BiobaseoligoClasses(> = 1.31.1),IRanges(> = 1.14.0),S4VectorsforeachmatrixStatsdata.table、网格晶格、方法、GenomeInfoDbcrlmm、工具
链接
建议 RUnitSNPchiphuman610quadv1bCrlmmBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18ArrayTV
SystemRequirements
增强了 doMCdoMPIdoSNOWdoParalleldoRedis
URL
全靠我 MinimumDistance
进口我
建议我 CNPBayesoligoClasses
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 VanillaICE_1.32.2.tar.gz
Windows二进制 VanillaICE_1.32.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) VanillaICE_1.32.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) VanillaICE_1.32.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/VanillaICE/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/VanillaICE/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心