要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“VanillaICE”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见VanillaICE.
Bioconductor版本:3.2
用于表征高通量SNP阵列中染色体改变的隐马尔科夫模型。
作者:Robert Scharpf
维护者:Robert Scharpf
引文(从R内,输入引用(“VanillaICE”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“VanillaICE”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“VanillaICE”)
crlmmDownstream | ||
VanillaICE装饰图案 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariation,软件 |
版本 | 1.32.2 |
在Bioconductor | BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年) |
许可证 | LGPL-2 |
取决于 | R (>= 3.0.0),BiocGenerics(> = 0.13.6),GenomicRanges(> = 1.19.47),SummarizedExperiment(> = 0.2.0) |
进口 | Biobase,oligoClasses(> = 1.31.1),IRanges(> = 1.14.0),S4Vectors,foreach,matrixStats,data.table、网格晶格、方法、GenomeInfoDb,crlmm、工具 |
链接 | |
建议 | RUnit,SNPchip,human610quadv1bCrlmm,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,ArrayTV |
SystemRequirements | |
增强了 | doMC,doMPI,doSNOW,doParallel,doRedis |
URL | |
全靠我 | MinimumDistance |
进口我 | |
建议我 | CNPBayes,oligoClasses |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | VanillaICE_1.32.2.tar.gz |
Windows二进制 | VanillaICE_1.32.2.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | VanillaICE_1.32.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | VanillaICE_1.32.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/VanillaICE/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/VanillaICE/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |