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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ToPASeq。

方案架构RNASeq通路分析数据

Bioconductor版本:3.2

实现七个方法架构RNASeq和微阵列数据通路分析:SPIA, DEGraph, TopologyGSA, TAPPA, PRS, PWEA和单一路径的可视化工具。

作者:伊凡娜Ihnatova,伊娃Budinska

维护人员:伊凡娜Ihnatova < Ihnatova在iba.muni.cz >

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PDF		R方案架构microaray和RNA-Seq数据的路径分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,GraphAndNetwork,微阵列,NetworkEnrichment,通路,RNASeq,软件,可视化
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(1.5年)
许可证	AGPL-3
取决于	石墨(> = 1.14),gRbase,图,locfit,Rgraphviz
进口	R.utils、方法、Biobase平行,刨边机,DESeq2,GenomicRanges,RBGL,DESeq,字段,limma,TeachingDemos,KEGGgraph,qpgraph,限幅器,AnnotationDbi,doParallel
链接	Rcpp
建议	RUnit,BiocGenerics,gageData,DEGraph,plotrix,org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ToPASeq_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	ToPASeq_1.4.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ToPASeq_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	ToPASeq_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/topaseq/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ToPASeq/
包下载报告	下载数据