要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TarSeqQC”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

TarSeqQC

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见TarSeqQC

定向测序实验质量控制

Bioconductor版本:3.2

该包允许用r来表示目标实验。这是基于当前的包,并包含了对这类实验进行质量控制和快速探索排序区域的功能。生成一个xlsx文件作为输出。

作者:加布里埃拉·a·梅里诺,克里斯托瓦尔·弗雷斯诺和埃尔默·a·费尔南德斯

维护者:Gabriela Merino

引文(从R内,输入引用(“TarSeqQC”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TarSeqQC”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TarSeqQC”)

PDF TarSeqQC:靶向测序实验质量控制
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐报道DataImport质量控制测序软件TargetedResequencing可视化
版本 1.0.3
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(>= 3.2.1),方法,GenomicRangesRsamtools(> = 1.20.4),ggplot2plyropenxlsx
进口 S4VectorsIRangesBiocGenericsreshape2GenomeInfoDbBiocParallelcowplot
链接
建议 RUnit
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bdmg.com.ar
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 TarSeqQC_1.0.3.tar.gz
Windows二进制 TarSeqQC_1.0.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) TarSeqQC_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) TarSeqQC_1.0.3.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/TarSeqQC/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TarSeqQC/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心