要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TarSeqQC”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见TarSeqQC.
Bioconductor版本:3.2
该包允许用r来表示目标实验。这是基于当前的包,并包含了对这类实验进行质量控制和快速探索排序区域的功能。生成一个xlsx文件作为输出。
作者:加布里埃拉·a·梅里诺,克里斯托瓦尔·弗雷斯诺和埃尔默·a·费尔南德斯
维护者:Gabriela Merino
引文(从R内,输入引用(“TarSeqQC”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TarSeqQC”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TarSeqQC”)
TarSeqQC:靶向测序实验质量控制 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 对齐,报道,DataImport,质量控制,测序,软件,TargetedResequencing,可视化 |
版本 | 1.0.3 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(>= 3.2.1),方法,GenomicRanges,Rsamtools(> = 1.20.4),ggplot2,plyr,openxlsx |
进口 | S4Vectors,IRanges,BiocGenerics,reshape2,GenomeInfoDb,BiocParallel,cowplot |
链接 | |
建议 | RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bdmg.com.ar |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | TarSeqQC_1.0.3.tar.gz |
Windows二进制 | TarSeqQC_1.0.2.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | TarSeqQC_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | TarSeqQC_1.0.3.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/TarSeqQC/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TarSeqQC/ |
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