##尝试http：//如果不支持https：// urls（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ tcgabiolinks”）

此软件包适用于生物导体的3.2版；对于稳定的最新版本，请参阅tcgabiolinks。

TCGABIOLINKS：与TCGA数据进行集成分析的R/生物导体包

生物导体版本：3.2

TCGABIOLINKS的目的是：i）促进TCGA开放访问数据检索，ii）使用适当的预处理策略准备数据，ii）提供了进行不同的标准分析的手段，iv）允许用户下载A数据的特定版本，因此很容易再现早期的研究结果。更详细地说，该软件包提供了多种分析方法（例如，差异表达分析，鉴定差异甲基化区域）和可视化方法（例如生存图，火山图，Starburst图），以便轻松地开发完整的分析管道。

作者：Antonio Colaprico，Tiago Chedraoui Silva，Catharina Olsen，Luciano Garofano，Davide Garolini，Claudia Cava，Thais Sabedot，Tathiane M. Malta，Stefano M. Pagnotta，Isabella Castiglioni，Micherele Ceccarelli，Micherele canrushruca nianlluca nianlluca bontempi，

维护者：ulb.ac.be>的Antonio Colaprico

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

##尝试http：//如果不支持https：// urls（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ tcgabiolinks”）

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Tcgabiolinks”）

html		使用TCGABIOLINKS软件包
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，差异性，，，，差甲基化，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，甲基化array，，，，网络，，，，途径，，，，软件，，，，生存
版本	1.0.10
在生物导体中	Bioc 3.2（R-3.2）（0.5岁）
执照	GPL（> = 3）
要看	R（> = 3.2）
进口	下载器（> = 0.4），ggally，grdevices，图形，基因组机，，，，XML，，，，生物酶，，，，副词，，，，heatmap.plus，，，，Xtable，，，，Data.Table，，，，EDASEQ（> = 2.0.0），rcurl，，，，EDGER（> = 3.0.0），rjson，，，，plyr，，，，cntools，，，，CGHMCR，，，，Biomart，，，，硬币，，，，GPLOTS，，，，GGPLOT2，，，，生存，，，，Stringr（> = 1.0.0），iranges，，，，秤，，，，rvest，统计，utils，dnet，，，，Igraph，，，，Suprahex，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，生物基因，，，，GenomicFeatures，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，林玛，，，，尼特，，，，DevTools，，，，GeneFilter，，，，共识ClusterPlus，，，，rcolorbrewer，，，，多帕尔，，，，dplyr， 平行，XML2
链接
建议	测试，，，，PNG，，，，生物使用，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	tcgabiolinks_1.0.10.tar.gz
Windows二进制	tcgabiolinks_1.0.10.zip
Mac OS X 10.6（雪豹）	tcgabiolinks_1.0.1.tgz
Mac OS X 10.9（Mavericks）	tcgabiolinks_1.0.10.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/tcgabiolinks/tree/release-3.2
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/tcgabiolinks/
软件包下载报告	下载统计