要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“summarizeexperiment”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SummarizedExperiment

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见SummarizedExperiment

SummarizedExperiment容器

Bioconductor版本:3.2

summarizeexperiment容器包含一个或多个测试,每个测试都由数字或其他模式的类似矩阵的对象表示。行通常表示感兴趣的基因组范围,列表示样本。

作者:马丁·摩根,瓦莱丽·奥本chain,吉姆·赫斯特,Hervé Pagès

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“SummarizedExperiment”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“summarizeexperiment”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SummarizedExperiment”)

超文本标记语言 协调实验测定、样品和感兴趣区域的总结实验
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释报道遗传学GenomeAnnotation基础设施测序软件
版本 1.0.2中
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.2),方法,GenomicRanges(> = 1.22.1),Biobase
进口 BiocGenerics(> = 0.15.3),S4Vectors(> = 0.7.11),IRangesGenomeInfoDb
链接
建议 注释AnnotationDbiGenomicFeaturesBiocStyleknitrrmarkdownjsonliterhdf5
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 气道ALDEx2AllelicImbalanceBiSeqbsseqcsawdeepSNVDESeq2DiffBindDREAM4dsQTLepigenomixepivizr裂变GenomicAlignmentsGenomicFilesgenosetgeuvPack工商管理硕士methylPipeminfiparathyroidSERIPSeekersimulatorZVanillaICEVariantAnnotation
进口我 biovizBaseBiSeqCOSMIC.67easyRNASeqEnrichmentBrowserFourCSeqGGBaseggbiogQTLstatsmethylumiMinimumDistanceoligoClassesR453Plus1Toolbox咆哮SeqArraySGSeqSNPchipsoGGisystemPipeRTCGAbiolinks
建议我 AnnotationHubbiobroomGenomicRangesinteractiveDisplay
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 SummarizedExperiment_1.0.2.tar.gz
Windows二进制 SummarizedExperiment_1.0.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) SummarizedExperiment_1.0.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) SummarizedExperiment_1.0.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/SummarizedExperiment/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SummarizedExperiment/
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