要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ somaticsignatures”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅躯体签名。
生物导体版本:3.2
体积签名包可以确定单核苷酸变体(SNV)的突变特征。它提供了与Nik-Zainal(2012,细胞)中描述的方法相关的基础架构,并具有矩阵分解算法的灵活性。
作者:Julian Gehring(Embl Heidelberg)
维护者:julian gehring
引用(从r内,输入引用(“ somaticsignatures”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ somaticsignatures”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ somaticsignatures”)
html | 躯体签名 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 聚类,,,,基因组变量,,,,测序,,,,软件,,,,somaticmmut,,,,统计信息,,,,可视化 |
版本 | 2.6.1 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(2年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.1.0),变体,,,,基因组机 |
进口 | S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,生物弦,,,,GGPLOT2,,,,GGBIO,,,,RESHAPE2,,,,NMF,,,,pcamethods,,,,生物酶, 方法,代理人 |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特, 平行,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,somaticccanceralterations,,,,ggdendro,,,,Fastica,,,,SVA |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/somaticsignatures.htmlhttps://github.com/julian-gehring/somaticsignatures-release |
取决于我 | |
进口我 | 稀有 |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | somaticsignatures_2.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | somaticsignatures_2.6.1.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | somaticsignatures_2.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | somaticsignatures_2.6.1.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/somaticsignatures/tree/release-3.2 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/somaticsignatures/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |