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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SeqArray。

大数据管理的全基因组序列变异

Bioconductor版本:3.2

大数据管理的全基因组序列变异与成千上万的个人:基因型数据(例如,单核苷酸多态性,indels调用)和结构变异在GDS和注释文件被存储在一个array-oriented和压缩方式,高效的数据访问使用R编程语言。

作者:Xiuwen郑(aut (cre),斯蒂芬妮Gogarten (aut),凯茜劳里(施)

维护人员:Xiuwen郑< zhengx u.washington.edu >

安装

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文档

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browseVignettes (“SeqArray”)

PDF		SeqArray-JSM2013.pdf
HTML		简要介绍数据分析SeqArray GDS文件
HTML		SeqArray——大数据管理的全基因组序列变异
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	遗传学,基础设施,测序,软件
版本	1.10.6
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	gdsfmt(> = 1.6.2)
进口	方法,Biostrings,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,VariantAnnotation,SummarizedExperiment
链接	gdsfmt
建议	平行,RUnit,BiocGenerics,knitr,Rcpp,SNPRelate
SystemRequirements
增强了
URL	http://github.com/zhengxwen/SeqArray
BugReports	http://github.com/zhengxwen/SeqArray/issues
取决于我	SeqVarTools
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	SeqArray_1.10.6.tar.gz
Windows二进制	SeqArray_1.10.6.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	SeqArray_1.10.3.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	SeqArray_1.10.6.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/seqarray/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SeqArray/
包下载报告	下载数据