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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPchip。

可视化的拷贝数变化

Bioconductor版本:3.2

这个包定义了高通量基因组数据的可视化方法

作者:罗伯特Scharpf < rscharpf jhu.edu >和Ingo Ruczinski

维护人员:罗伯特Scharpf < rscharpf jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (“SNPchip”)

PDF		绘制染色体组型
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,GeneticVariability,单核苷酸多态性,软件,可视化
版本	2.16.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(9年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.14.0)
进口	方法、图形晶格、网格foreach跑龙套,Biobase,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,SummarizedExperiment,oligoClasses(> = 1.31.1)
链接
建议	crlmm(> = 1.17.14),RUnit
SystemRequirements
增强了	doSNOW,VanillaICE(> = 1.21.24),RColorBrewer
URL	http://www.biostat.jhsph.edu/ iruczins /软件/ snpchip.html
取决于我	mBPCR
进口我	crlmm,phenoTest
建议我	类别,MinimumDistance,oligoClasses,VanillaICE
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	SNPchip_2.16.0.tar.gz
Windows二进制	SNPchip_2.16.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	SNPchip_2.16.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	SNPchip_2.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/snpchip/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/
包下载报告	下载数据