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此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅rnbeads。
生物导体版本:3.2
RNBEADS促进了对基因组量表各种类型的DNA甲基化数据的全面分析。
作者:Yassen Assenov [AUT],Pavlo Lutsik [AUT],Fabian Mueller [AUT,CRE]
维护者:fabian Mueller
引用(从r内,输入引用(“ rnbeads”)
):
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browsevignettes(“ rnbeads”)
综合DNA甲基化分析与RNBEADS | ||
rnbeads注释 | ||
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 |
生物浏览 | 批处理效应,,,,CPGISLAND,,,,DNAMETHYLATY,,,,DataImport,,,,差甲基化,,,,表观遗传学,,,,甲基,,,,甲基化array,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件,,,,两通道 |
版本 | 1.2.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(1年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.0.0),生物基因,,,,基因组机,,,,大量的,,,,rcolorbrewer,,,,簇,,,,ff,,,,字段,,,,GGPLOT2(> = 0.9.2),GPLOTS,,,,栅格,,,,林玛,,,,矩阵, 方法,Illuminaio,,,,甲基菌,,,,plyr |
进口 | iranges |
链接 | |
建议 | 类别,,,,地球,,,,gostats,,,,GVIZ,,,,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,,,,rpmm,,,,Reffreeewas,,,,rnbeads.hg19,,,,XML,,,,注释,,,,Biomart,,,,foreach,,,,多帕尔,,,,GGBIO,,,,ISVA,,,,mclust,,,,MGCV,,,,Minfi,,,,nlme,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,Quadprog,,,,rtracklayer,,,,SVA,,,,西瓜,,,,WordCloud,,,,argparse |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | rnbeads.hg19,,,,rnbeads.hg38,,,,rnbeads.mm10,,,,rnbeads.mm9,,,,rnbeads.rn5 |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | rnbeads_1.2.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | rnbeads_1.2.2.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | rnbeads_1.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | rnbeads_1.2.2.2.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/rnbeads/tree/release-3.2 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rnbeads/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |