安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Rcade”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Rcade。
Bioconductor版本:3.2
Rcade(代表“R-based ChIP-seq和微分表达式的分析”)是一个集成的工具与微分表达式ChIP-seq数据汇总数据,通过贝叶斯框架。鉴别的关键应用程序感兴趣的基因转录因子的目标——也就是说,我们收集相关基因ChIP-seq峰,和微分表达式在某些扰动相关的特遣部队。
作者:乔纳森·凯恩斯
维护人员:乔纳森·凯恩斯< jmcairns200 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“Rcade”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Rcade”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Rcade”)
Rcade装饰图案 | ||
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | ChIPSeq,DifferentialExpression,GeneExpression,遗传学,测序,软件,转录 |
版本 | 1.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R(> = 2.14.0)、方法GenomicRanges,baySeq,Rsamtools |
进口 | 图形,S4Vectors,rgl,plotrix |
链接 | |
建议 | limma,biomaRt,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | Rcade_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | Rcade_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | Rcade_1.12.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | Rcade_1.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/rcade/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rcade/ |
包下载报告 | 下载数据 |