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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rtn”)

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RTN

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅RTN

转录网络的重建和主监管机构的分析

生物导体版本:3.2

该软件包提供了转录网络推理和分析的类和方法。转录因子活性的调节剂通过条件相互信息评估,并使用不同的策略(例如基因集富集,阴影和协同作用分析)将主调节剂映射到表型。此外,使用EQTL/VSE分析可以将主调节剂与遗传标记链接,利用映射到人类基因组的单倍型块结构,以探索在GWAS研究中鉴定的风险相关的SNP。

作者:毛罗·卡斯特罗(Mauro Castro),Xin Wang,Michael Fletcher,Florian Markowetz和Kerstin Meyer

维护者:毛罗·卡斯特罗(Mauro Castro)

引用(从r内,输入引用(“ RTN”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ RTN”)

PDF 主要小插图:R中转录网络的重建和分析
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,结肠管制,,,,基因烯,,,,遗传因素,,,,GraphandNetwork,,,,网络分析,,,,NetworkEnrichment,,,,网络引导,,,,SNP,,,,软件
版本 1.8.4
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.15),方法,Igraph
进口 Reder,,,,模丝,,,,,,,,林玛,,,,Data.Table,,,,ff,,,,,,,,iranges
链接
建议 HTSANALYZER,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL http://dx.doi.org/10.1038/ncomms3464
取决于我 Fletcher2013b
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 rtn_1.8.4.4.tar.gz
Windows二进制 rtn_1.8.4.4.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) rtn_1.8.1.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) rtn_1.8.4.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/rtn/tree/release-3.2
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rtn/
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