安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“RMassBank”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RMassBank。
Bioconductor版本:3.2
工作流过程串联文件女士和构建MassBank记录。功能包括自动提取光谱女士串联,公式分配串联女士片段,调整与指定片段串联女士光谱,光谱清理,自动从互联网数据库,检索化合物信息和出口MassBank记录。
作者:迈克尔•Stravs艾玛·Schymanski Steffen Neumann埃里克•穆勒Schulze托拜厄斯的贡献
维护人员:RMassBank Eawag < massbank在eawag.ch >
从内部引用(R,回车引用(“RMassBank”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“RMassBank”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“RMassBank”)
RMassBank非标准用法 | ||
RMassBank使用XCMS预排 | ||
RMassBank预排 | ||
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
版本 | 1.12.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Rcpp |
进口 | XML,RCurl,rjson,rcdk,yaml,mzR、方法 |
链接 | |
建议 | gplots,RMassBankData,xcms(> = 1.37.1),相机,ontoCAT,RUnit |
SystemRequirements | OpenBabel |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | RMassBankData |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | RMassBank_1.12.1.tar.gz |
Windows二进制 | RMassBank_1.12.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | RMassBank_1.12.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | RMassBank_1.12.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/rmassbank/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RMassBank/ |
包下载报告 | 下载数据 |