要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RIPSeeker”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

RIPSeeker

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见RIPSeeker

RIPSeeker:用于从RIP-seq实验中识别蛋白质相关转录本的统计包

Bioconductor版本:3.2

利用负二项发射概率的两态HMM从RIP-seq对准中推断和区分RIP峰值。虽然RIPSeeker是专门为RIP-seq数据分析量身定制的,但它还提供了一套生物信息学工具,集成在这个独立的软件包中,全面解决了从对齐后处理到可视化和注释等问题。

作者:李越

维护者:Yue Li

引文(从R内,输入引用(“RIPSeeker”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RIPSeeker”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RIPSeeker”)

PDF RIPSeeker:用于从RIP-seq实验中识别蛋白质相关转录本的统计包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews RIPSeq测序软件
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 GPL-2
取决于 R(>= 2.15),方法,IRangesGenomicRangesSummarizedExperimentRsamtoolsGenomicAlignmentsrtracklayer
进口
链接
建议 biomaRtChIPpeakAnno平行,GenomicFeatures
SystemRequirements
增强了
URL http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/software.html
全靠我 RIPSeekerData
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 RIPSeeker_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 RIPSeeker_1.10.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) RIPSeeker_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) RIPSeeker_1.10.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/RIPSeeker/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RIPSeeker/
软件包下载报告 下载数据

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支持»

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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
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