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R453Plus1Toolbox

这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅R453Plus1Toolbox

一个包的导入从罗氏的基因组定序器系统和分析数据

Bioconductor版本:3.2

R453Plus1工具箱包含有用的函数生成的数据分析罗氏的454测序平台。它增加了功能质量保证以及注释和可视化的检测基因变异,补充的软件工具运送罗氏公司和他们的产品。此外,管道检测的结构变异。

作者:汉斯Klein Christoph Bartenhagen基督教Ruckert

维护人员:汉斯克莱因< h。克莱恩在uni-muenster.de >

从内部引用(R,回车引用(“R453Plus1Toolbox”)):

安装

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PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,DataRepresentation,基础设施,质量控制,ReportWriting,测序,软件,可视化
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 2.7 (r - 2.12)(5.5年)
许可证 LGPL-3
取决于 R(> = 2.12.0)、方法VariantAnnotation,Biostrings,Biobase
进口 跑龙套,grDevices、图形、数据、工具xtable,R2HTML,TeachingDemos,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,XVector,GenomicRanges,SummarizedExperiment,biomaRt,BSgenome,Rsamtools,ShortRead
链接
建议 rtracklayer,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2
SystemRequirements
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 R453Plus1Toolbox_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 R453Plus1Toolbox_1.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) R453Plus1Toolbox_1.20.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛) R453Plus1Toolbox_1.20.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/r453plus1toolbox/tree/release - 3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/R453Plus1Toolbox/
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