安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“R453Plus1Toolbox”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅R453Plus1Toolbox。
Bioconductor版本:3.2
R453Plus1工具箱包含有用的函数生成的数据分析罗氏的454测序平台。它增加了功能质量保证以及注释和可视化的检测基因变异,补充的软件工具运送罗氏公司和他们的产品。此外,管道检测的结构变异。
作者:汉斯Klein Christoph Bartenhagen基督教Ruckert
维护人员:汉斯克莱因< h。克莱恩在uni-muenster.de >
从内部引用(R,回车引用(“R453Plus1Toolbox”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“R453Plus1Toolbox”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“R453Plus1Toolbox”)
一个包的导入从罗氏的基因组定序器系统和分析数据 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,基础设施,质量控制,ReportWriting,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.7 (r - 2.12)(5.5年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | R(> = 2.12.0)、方法VariantAnnotation,Biostrings,Biobase |
进口 | 跑龙套,grDevices、图形、数据、工具xtable,R2HTML,TeachingDemos,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,XVector,GenomicRanges,SummarizedExperiment,biomaRt,BSgenome,Rsamtools,ShortRead |
链接 | |
建议 | rtracklayer,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | R453Plus1Toolbox_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | R453Plus1Toolbox_1.20.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | R453Plus1Toolbox_1.20.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | R453Plus1Toolbox_1.20.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/r453plus1toolbox/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/R453Plus1Toolbox/ |
包下载报告 | 下载数据 |