要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ pbase”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅PBase。
生物导体版本:3.2
在蛋白质组学实验的背景下研究和理解蛋白质序列数据的一组类和功能。
作者:Laurent Gatto [AUT],Sebastian Gibb [AUT,CRE]
维护者:塞巴斯蒂安·吉布(Sebastian gibb
引用(从r内,输入引用(“ PBASE”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ pbase”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ PBASE”)
html | Enembl和UCSC映射 | |
html | 映射 | |
html | PBASE-DATA | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,datarepresentation,,,,基础设施,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 0.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(1年) |
执照 | GPL-3 |
依靠 | R(> = 2.10),方法,生物基因,,,,RCPP,,,,GVIZ |
进口 | 切肉刀(> = 1.3.6),生物酶,,,,生物弦,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,mzid,,,,MZR(> = 1.99.1),MSNBase(> = 1.15.5),PVIZ,,,,Biomart,,,,基因组机,,,,rtracklayer |
链接 | |
建议 | 测试(> = 0.8),GGPLOT2,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,AnnotationHub,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/computitationalproteomicsunit/pbase |
BugReports | https://github.com/computationalProteomicSunit/pbase/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | pbase_0.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | PBASE_0.10.0.ZIP |
Mac OS X 10.6(雪豹) | pbase_0.10.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | pbase_0.10.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/pbase/tree/release-3.2 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pbase/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |