安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Path2PPI”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Path2PPI。
Bioconductor版本:3.2
包特定蛋白质相互作用预测途径(PPI)网络在目标生物的质子泵抑制剂只有一个视图的信息是可用的。Path2PPI使用质子泵抑制剂的兴趣从其他的途径建立生物模型预测某种途径在目标生物。Path2PPI只取决于相关蛋白质的序列相似性。
作者:奥利弗·菲利普(aut (cre),在科赫(施)
维修工:奥利弗·菲利普< o。菲利普在bioinformatik.uni-frankfurt.de >
从内部引用(R,回车引用(“Path2PPI”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Path2PPI”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Path2PPI”)
HTML | Path2PPI包 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 网络,NetworkInference,通路,蛋白质组学,软件,SystemsBiology |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(0.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.2.1),igraph(> = 1.0.1)方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bioinformatik.uni-frankfurt.de/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | Path2PPI_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | Path2PPI_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | Path2PPI_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | Path2PPI_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/path2ppi/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Path2PPI/ |
包下载报告 | 下载数据 |