安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“OrganismDbi”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅OrganismDbi。
Bioconductor版本:3.2
包允许一个简单的统一界面几个注释包每个有自己的模式通过利用这样的事实,这些包实现了选择方法。
作者:马克•卡尔森Herve页,瓦莱丽Obenchain马丁•摩根
维护人员:Biocore数据团队<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“OrganismDbi”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“OrganismDbi”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“OrganismDbi”)
OrganismDbi:元注释框架包 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,基础设施,软件 |
版本 | 1.12.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(> = 2.14.0)、方法BiocGenerics(> = 0.15.10),AnnotationDbi(> = 1.31.19),GenomicFeatures(> = 1.21.12) |
进口 | Biobase,BiocInstaller,GenomicRanges,图,IRanges,RBGL,RSQLite,S4Vectors,统计数据 |
链接 | |
建议 | Homo.sapiens,Rattus.norvegicus,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,biomaRt,rtracklayer,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | Homo.sapiens,Mus.musculus,Rattus.norvegicus |
进口我 | AnnotationHubData,epivizr,ggbio |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | OrganismDbi_1.12.1.tar.gz |
Windows二进制 | OrganismDbi_1.12.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | OrganismDbi_1.12.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | OrganismDbi_1.12.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/organismdbi/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/OrganismDbi/ |
包下载报告 | 下载数据 |