安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MotifDb”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MotifDb。
Bioconductor版本:3.2
超过2000的带注释的位置频率矩阵从9个公共资源,为多个生物。
作者:保罗·香农
维修工:保罗·香农< paul.thurmond。香农在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“MotifDb”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MotifDb”)
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browseVignettes (“MotifDb”)
MotifDb概述 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | MotifAnnotation,软件 |
版本 | 1.12.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |文件许可 |
取决于 | R(> = 2.15.0)、方法BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,Biostrings |
进口 | rtracklayer |
链接 | |
建议 | RUnit,seqLogo,MotIV |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | motifbreakR |
进口我 | rTRMui |
建议我 | DiffLogo,motifStack,PWMEnrich,rTRM,vtpnet |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | MotifDb_1.12.1.tar.gz |
Windows二进制 | MotifDb_1.12.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | MotifDb_1.12.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | MotifDb_1.12.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/motifdb/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MotifDb/ |
包下载报告 | 下载数据 |