# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MotIV”)

这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MotIV。

主题识别和验证

Bioconductor版本:3.2

这个包利用邮票图案的比较一组给定的数据库(例如JASPAR)。它还可以用于可视化主题,主题分布,模块和滤波器图案。

作者:以罗伊Mercier、拉斐尔Gottardo

维护人员:以罗伊Mercier < emercier bcgsc。ca >,拉斐尔Gottardo < rgottard fhcrc.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MotIV”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF		MotIV用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,ChIPchip,GenomicSequence,微阵列,MotifAnnotation,软件
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),BiocGenerics(> = 0.1.0)
进口	图形、网格、方法S4Vectors,IRanges(> = 1.13.5),Biostrings(> = 1.24.0),晶格,rGADEM,跑龙套
链接
建议	rtracklayer
SystemRequirements	GNU科学图书馆> = 1.6 (http://www.gnu.org/software/gsl/)
增强了
URL
取决于我	motifStack
进口我
建议我	MotifDb
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	MotIV_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	MotIV_1.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	MotIV_1.26.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	MotIV_1.26.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/motiv/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MotIV/
包下载报告	下载数据