要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MatrixRider”)
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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见MatrixRider.
Bioconductor版本:3.2
计算整个序列的单个数字,反映DNA结合蛋白与其相互作用的倾向。DNA结合蛋白必须用PFM矩阵来描述,例如从Jaspar得到的PFM矩阵。
作者:Elena Grassi
维护者:Elena Grassi < Grassi。E在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“MatrixRider”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MatrixRider”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MatrixRider”)
完全的亲和和占有 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneRegulation,遗传学,MotifAnnotation,软件 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.1.2) |
进口 | 方法,TFBSTools,IRanges,XVector,Biostrings |
链接 | IRanges,XVector,Biostrings,S4Vectors |
建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,JASPAR2014 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | MatrixRider_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | MatrixRider_1.2.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | MatrixRider_1.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | MatrixRider_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/MatrixRider/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MatrixRider/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |