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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见MatrixRider．

获得给定序列上结合位点矩阵的总亲和度和占用率

Bioconductor版本:3.2

计算整个序列的单个数字，反映DNA结合蛋白与其相互作用的倾向。DNA结合蛋白必须用PFM矩阵来描述，例如从Jaspar得到的PFM矩阵。

作者:Elena Grassi

维护者:Elena Grassi < Grassi。E在gmail.com>

安装

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文档

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browseVignettes(“MatrixRider”)

PDF		完全的亲和和占有
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，遗传学，MotifAnnotation，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.1.2)
进口	方法,TFBSTools，IRanges，XVector，Biostrings
链接	IRanges，XVector，Biostrings，S4Vectors
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle，JASPAR2014
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	MatrixRider_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MatrixRider_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	MatrixRider_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	MatrixRider_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/MatrixRider/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MatrixRider/
软件包下载报告	下载数据