要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“LOLA”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

萝拉

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见萝拉

位置重叠分析富集基因组范围

Bioconductor版本:3.2

提供与公共和自定义区域集(基因组范围)数据库测试基因组区域集重叠的功能。这使得对基因组区域集进行自动化富集分析成为可能,从而促进了功能基因组学和表观基因组学数据的解释。

作者:Nathan Sheffield [aut, cre], Christoph Bock [cre]

维护者:Nathan Sheffield < Nathan at code.databio.org>

引文(从R内,输入引用(“洛拉”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“LOLA”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“洛拉”)

超文本标记语言 选择LOLA宇宙
超文本标记语言 从LOLA开始
超文本标记语言 使用LOLA核心
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeqFunctionalGenomicsGeneRegulationGeneSetEnrichmentGenomeAnnotationMethylSeq测序软件SystemsBiology
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 GenomicRangesIRangesdata.table
链接
建议 knitr平行,BiocGenericstestthat
SystemRequirements
增强了 simpleCache,qvalue
URL http://databio.org/lola
BugReports http://github.com/sheffien/LOLA
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 LOLA_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 LOLA_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) LOLA_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) LOLA_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/LOLA/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/LOLA/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心