要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“LOLA”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见萝拉.
Bioconductor版本:3.2
提供与公共和自定义区域集(基因组范围)数据库测试基因组区域集重叠的功能。这使得对基因组区域集进行自动化富集分析成为可能,从而促进了功能基因组学和表观基因组学数据的解释。
作者:Nathan Sheffield
维护者:Nathan Sheffield < Nathan at code.databio.org>
引文(从R内,输入引用(“洛拉”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“LOLA”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“洛拉”)
超文本标记语言 | 选择LOLA宇宙 | |
超文本标记语言 | 从LOLA开始 | |
超文本标记语言 | 使用LOLA核心 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ChIPSeq,FunctionalGenomics,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GenomeAnnotation,MethylSeq,测序,软件,SystemsBiology |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | GenomicRanges,IRanges,data.table |
链接 | |
建议 | knitr平行,BiocGenerics,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | simpleCache,qvalue |
URL | http://databio.org/lola |
BugReports | http://github.com/sheffien/LOLA |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | LOLA_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | LOLA_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | LOLA_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | LOLA_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/LOLA/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LOLA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |