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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见IRanges．

用于在序列上操作间隔的基础结构

Bioconductor版本:3.2

该包提供了高效的低级和高度可重用的S4类，用于存储整数范围、RLE向量(运行长度编码)，以及更一般的可以按顺序组织的数据(正式定义为Vector对象)，以及这些Vector对象的视图。还提供了高效的类列表，用于存储基本类的大型实例集合。包中的所有类都使用一致的命名，并尽可能共享相同的丰富且一致的“Vector API”。

作者:H.佩奇、P.阿布尤、M.劳伦斯

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

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文档

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PDF		IRanges简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，基础设施，软件
版本	2.4.8
在Bioconductor	BioC 2.3 (R-2.8)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.1.0)，方法，utils，统计，BiocGenerics(> = 0.15.10),S4Vectors(> = 0.8.4)
进口	stats4
链接	S4Vectors
建议	XVector，GenomicRanges，BSgenome.Celegans.UCSC.ce2，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	AnnotationDbi，AnnotationHubData，BayesPeak，biomvRCNS，Biostrings，BiSeq，BSgenome，bsseq，BubbleTree，bumphunter，咖啡馆，卡斯珀，CexoR，ChIPComp，ChIPpeakAnno，chipseq，chroGPS，cn.mops，CSAR，customProDB，DASiR，deepSNV，DESeq2，DEXSeq，DirichletMultinomial，DMRcaller，EnrichedHeatmap，epigenomix，exomeCopy，FunciSNP.data，geneRxCluster，GenomeInfoDb，基因组，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicRanges，Genominator，groHMM，GUIDEseq，吉他，Gviz，harbChIP，HilbertCurve，HiTC，HMMcopy，htSeqTools，IdeoViz，LiebermanAidenHiC2009，methyAnalysis，MotifDb，motifRG，oneChannelGUI，OTUbase，pd.ag，pd.aragene.1.0.st，pd.aragene.1.1.st，pd.ath1.121501，pd.barley1，pd.bovgene.1.0.st，pd.bovgene.1.1.st，pd.bovine，pd.bsubtilis，pd.cangene.1.0.st，pd.cangene.1.1.st，pd.canine，pd.canine.2，pd.celegans，pd.chicken，pd.chigene.1.0.st，pd.chigene.1.1.st，pd.chogene.2.0.st，pd.chogene.2.1.st，pd.citrus，pd.cotton，pd.cyngene.1.0.st，pd.cyngene.1.1.st，pd.cyrgene.1.0.st，pd.cyrgene.1.1.st，pd.cytogenetics.array，pd.drogene.1.0.st，pd.drogene.1.1.st，pd.drosgenome1，pd.drosophila.2，pd.e.coli.2，pd.ecoli，pd.ecoli.asv2，pd.elegene.1.0.st，pd.elegene.1.1.st，pd.equgene.1.0.st，pd.equgene.1.1.st，pd.felgene.1.0.st，pd.felgene.1.1.st，pd.fingene.1.0.st，pd.fingene.1.1.st，pd.genomewidesnp.5，pd.genomewidesnp.6，pd.guigene.1.0.st，pd.guigene.1.1.st，pd.hc.g110，pd.hg.focus，pd.hg.u133.plus.2，pd.hg.u133a，pd.hg.u133a.2，pd.hg.u133a.tag，pd.hg.u133b，pd.hg.u219，pd.hg.u95a，pd.hg.u95av2，pd.hg.u95b，pd.hg.u95c，pd.hg.u95d，pd.hg.u95e，pd.hg18.60mer.expr，pd.ht.hg.u133.plus.pm，pd.ht.hg.u133a，pd.ht.mg.430a，pd.hta.2.0，pd.hu6800，pd.huex.1.0.st.v2，pd.hugene.1.0.st.v1，pd.hugene.1.1.st.v1，pd.hugene.2.0.st，pd.hugene.2.1.st，pd.maize，pd.mapping250k.nsp，pd.mapping250k.sty，pd.mapping50k.hind240，pd.mapping50k.xba240，pd.margene.1.0.st，pd.margene.1.1.st，pd.medgene.1.0.st，pd.medgene.1.1.st，pd.medicago，pd.mg.u74a，pd.mg.u74av2，pd.mg.u74b，pd.mg.u74bv2，pd.mg.u74c，pd.mg.u74cv2，pd.mirna.1.0，pd.mirna.2.0，pd.mirna.3.0，pd.mirna.4.0，pd.moe430a，pd.moe430b，pd.moex.1.0.st.v1，pd.mogene.1.0.st.v1，pd.mogene.1.1.st.v1，pd.mogene.2.0.st，pd.mogene.2.1.st，pd.mouse430.2，pd.mouse430a.2，pd.mta.1.0，pd.mu11ksuba，pd.mu11ksubb，pd.nugo.hs1a520180，pd.nugo.mm1a520177，pd.ovigene.1.0.st，pd.ovigene.1.1.st，pd.pae.g1a，pd.plasmodium.anopheles，pd.poplar，pd.porcine，pd.porgene.1.0.st，pd.porgene.1.1.st，pd.rabgene.1.0.st，pd.rabgene.1.1.st，pd.rae230a，pd.rae230b，pd.raex.1.0.st.v1，pd.ragene.1.0.st.v1，pd.ragene.1.1.st.v1，pd.ragene.2.0.st，pd.ragene.2.1.st，pd.rat230.2，pd.rcngene.1.0.st，pd.rcngene.1.1.st，pd.rg.u34a，pd.rg.u34b，pd.rg.u34c，pd.rhegene.1.0.st，pd.rhegene.1.1.st，pd.rhesus，pd.rice，pd.rjpgene.1.0.st，pd.rjpgene.1.1.st，pd.rn.u34，pd.rta.1.0，pd.rusgene.1.0.st，pd.rusgene.1.1.st，pd.s.aureus，pd.soybean，pd.soygene.1.0.st，pd.soygene.1.1.st，pd.sugar.cane，pd.tomato，pd.u133.x3p，pd.vitis.vinifera，pd.wheat，pd.x.laevis.2，pd.x.tropicalis，pd.xenopus.laevis，pd.yeast.2，pd.yg.s98，pd.zebgene.1.0.st，pd.zebgene.1.1.st，pd.zebrafish，pepStat，PGA，平，proBAMr，PSICQUIC，RefNet，rfPred，rGADEM，rGREAT，RIPSeeker，rMAT，Rsamtools，scsR，segmentSeq，SGSeq，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37，SomatiCA，TEQC，TitanCNA，tra利用，triform，三层，VariantTools，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38，XVector
进口我	ALDEx2，AllelicImbalance，annmap，AnnotationDbi，ArrayExpressHTS，舞会礼服，bamsignals，BayesPeak，beadarray，Biostrings，biovizBase，BiSeq，BitSeq，BSgenome，篮球选手，cgdv17，冠军，魅力，chipenrich，chipenrich.data，ChIPQC，ChIPseeker，chipseq，ChIPseqR，ChIPsim，ChromHeatMap，切肉刀，cn，CNPBayes，CNVPanelizer，CNVrd2，cobindR，彗星，compEpiTools，conumee，copynumber，文案，CoverageView，CRISPRseek，csaw，customProDB，解读，derfinder，derfinderHelper，derfinderPlot，DiffBind，diffHic，DMRcate，DOQTL，easyRNASeq，EDASeq，埃尔默，ensembldb，facopy，fastseg，FindMyFriends，啪嗒啪嗒地响，flowQ，FunciSNP，genomation，genomeIntervals，GenomicAlignments，GenomicFiles，GenomicInteractions，GenomicTuples，genoset，genotypeeval，GGBase，ggbio，GGtools，girafe，gmapR，GoogleGenomics，哥特，gQTLstats，gwascat，h5vc，HTSeqGenie，InPAS，检查，intansv，iva，萝拉，M3D，MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123，MafDb.ALL.wgs.phase3.release.v5a.20130502，MafDb.ALL.wgs.phase3.release.v5b.20130502，MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137，MafDb.ExAC.r0.3.sites，MatrixRider，餐，MEDIPS，metagene，methVisual，methyAnalysis，methylPipe，MethylSeekR，methylumi，minfi，MinimumDistance，MMDiff，马赛克，motifbreakR，motifRG，MotIV，msa，MSnbase，NarrowPeaks，诊断，oligoClasses，OrganismDbi，Pbase，pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1，pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter，pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter，pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter，pd.atdschip.tiling，pd.charm.hg18.example，pd.feinberg.hg18.me.hx1，pd.feinberg.mm8.me.hx1，pd.mirna.3.1，pdInfoBuilder，phastCons100way.UCSC.hg19，phastCons100way.UCSC.hg38，phastCons7way.UCSC.hg38，图片，平，plethy，podkat，聚酯，prebs，Pviz，qpgraph，QuasR，R3CPET，r3Cseq，R453Plus1Toolbox，RareVariantVis，Rariant，rCGH，REDseq，regionReport，Repitools，ReportingTools，rGADEM，RiboProfiling，rMAT，rnaSeqMap，RnBeads，Rolexa，Rqc，rSFFreader，RSVSim，研制，rtracklayer，扫描。通用产品，SeqArray，seqPattern，seqplots，SeqVarTools，ShortRead，SICtools，simulatorZ，skewr，SNPchip，SNPhood，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38，soGGi，SomatiCA，SomaticCancerAlterations，SomaticSignatures，连接工具，spliceSites，SplicingGraphs，SummarizedExperiment，SVM2CRM，TarSeqQC，TCGAbiolinks，TFBSTools，tracktables，trackViewer，TransView，triform，TSSi，VanillaICE，VariantAnnotation，VariantFiltering，wavClusteR，waveTiling，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38，XVector
建议我	AnnotationHub，BaseSpaceR，BiocGenerics，ClassifyR，gQTLBase，HilbertVis，HilbertVisGUI，海市蜃楼，S4Vectors，斯坦，yeastRNASeq
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	IRanges_2.4.8.tar.gz
Windows二进制	IRanges_2.4.8.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	IRanges_2.4.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	IRanges_2.4.8.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/IRanges/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IRanges/
软件包下载报告	下载数据