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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HMMcopy。

拷贝数预测与GC和高温超导mappability偏差校正数据

Bioconductor版本:3.2

纠正GC和readcounts mappability偏见(即覆盖)在非重叠窗口固定长度的单全基因组样本,产生一个粗略的估计的拷贝数进行进一步分析。设计快速校正的高覆盖率全基因组肿瘤和正常样本。

作者:丹尼尔·赖加文·哈,索拉博沙

维修工:丹尼尔赖< jujubix cs.ubc。ca >,加文·哈< gha bccrc。ca >,索拉博沙< sshah在bccrc.ca >

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PDF		HMMcopy
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,微阵列,预处理,测序,软件,可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10.0),IRanges(> = 1.4.16),geneplotter(> = 1.24.0)
进口
链接
建议
SystemRequirements
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取决于我
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建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	HMMcopy_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	HMMcopy_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	HMMcopy_1.12.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	HMMcopy_1.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/hmmcopy/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HMMcopy/
包下载报告	下载数据