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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见GreyListChIP．

灰色列表——基于芯片输入的掩码人工制品区域

Bioconductor版本:3.2

识别ChIP实验中输入高信号的区域，在峰值调用期间导致伪峰。在峰值调用之前删除对准这些区域的读取，以便更清晰地进行ChIP分析。

作者:Gord Brown

维护者:戈登布朗<戈登。布朗在cruk.cam.ac.uk>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GreyListChIP”)

文档

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browseVignettes(“GreyListChIP”)

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文本		新闻

细节

biocViews	对齐，ChIPSeq，报道，DifferentialPeakCalling，GenomeAnnotation，预处理，测序，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.1)，方法，GenomicRanges
进口	GenomicAlignments，BSgenome，Rsamtools，rtracklayer，质量平行,GenomeInfoDb
链接
建议	BiocStyle，BiocGenerics，RUnit
SystemRequirements
增强了	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	GreyListChIP_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	GreyListChIP_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	GreyListChIP_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	GreyListChIP_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GreyListChIP/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GreyListChIP/
软件包下载报告	下载数据