要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GoogleGenomics”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GoogleGenomics

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见GoogleGenomics

R客户端谷歌基因组API

Bioconductor版本:3.2

提供一个R包来与谷歌Genomics API交互。

作者:Cassie Doll [aut], Nicole Deflaux [aut], Siddhartha Bagaria [aut, cre]

维护者:Siddhartha Bagaria

引文(从R内,输入引用(“GoogleGenomics”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GoogleGenomics”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GoogleGenomics”)

超文本标记语言 注释变体
超文本标记语言 绘制平面图
超文本标记语言 再现变体注释结果
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DataImport软件ThirdPartyClient
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 Apache License (== 2.0) | file License
取决于 R (>= 3.1.0),GenomicAlignments(> = 1.0.1),VariantAnnotation
进口 BiostringsGenomeInfoDbGenomicRangesIRangeshttrrjsonRsamtoolsS4Vectors
链接
建议 BiocStylehttpuvknitrrmarkdowntestthatggbioggplot2BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19org.Hs.eg.dbTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL https://cloud.google.com/genomics/
BugReports https://github.com/Bioconductor/GoogleGenomics/issues
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 GoogleGenomics_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 GoogleGenomics_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) GoogleGenomics_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) GoogleGenomics_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GoogleGenomics/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GoogleGenomics/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心