要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GoogleGenomics”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见GoogleGenomics.
Bioconductor版本:3.2
提供一个R包来与谷歌Genomics API交互。
作者:Cassie Doll [aut], Nicole Deflaux [aut], Siddhartha Bagaria [aut, cre]
维护者:Siddhartha Bagaria
引文(从R内,输入引用(“GoogleGenomics”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GoogleGenomics”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GoogleGenomics”)
超文本标记语言 | 注释变体 | |
超文本标记语言 | 绘制平面图 | |
超文本标记语言 | 再现变体注释结果 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DataImport,软件,ThirdPartyClient |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | Apache License (== 2.0) | file License |
取决于 | R (>= 3.1.0),GenomicAlignments(> = 1.0.1),VariantAnnotation |
进口 | Biostrings,GenomeInfoDb,GenomicRanges,IRanges,httr,rjson,Rsamtools,S4Vectors |
链接 | |
建议 | BiocStyle,httpuv,knitr,rmarkdown,testthat,ggbio,ggplot2,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://cloud.google.com/genomics/ |
BugReports | https://github.com/Bioconductor/GoogleGenomics/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GoogleGenomics_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | GoogleGenomics_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GoogleGenomics_1.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | GoogleGenomics_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GoogleGenomics/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GoogleGenomics/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |